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农业有机废弃物包括农业生产产生的各类农作物秸秆，以及畜禽养殖产生的畜禽粪便等，处理难度较大，是环境治理的难题。将农业有机废弃物畜禽粪便、秸杆等作为可利用的资源进行好氧发酵 ，不仅可以解决农业生产废物对环境的污染问题，同时生产出来的有机肥可以带来收益，实现了废弃物的无害化、减量化、资源化，符合我国对环境保护和资源可持续利用的政策方针。
目前，国内现有的一些畜禽粪便发酵技术普遍存在着发酵，远距离运输，集中处理高成本的问题。同时因为发酵工艺落后，占地面积大，发酵过程中因发酵工艺落后造成地下水的污染和因发酵不全产生的气味，使蚊蝇滋生对周围环境产生严重影响。同时发酵生产受气候影响严重，雨雪天无常工作，冬季因低温导致设备无法处理粪便的现象。发酵时间普遍长达1-2个月，耗费工作人员数量多。
菌肥的使用方法：
1. 施用量：一般情况下，每亩土地使用菌肥的量为10-15公斤。
2. 施用时间：菌肥可与基肥一同施用，也可作为追肥使用。一般在种植前2-3周施用，或者在植物生长期间按需追肥。
3. 施用方式：菌肥可直接撒在土壤表面，然后轻轻耕入土中，也可与底肥或追肥混合使用。
需要注意的是，菌肥的保存要避免阳光直射和高温环境，尽量保存在阴凉干燥处。此外，在施用菌肥时，应避免与农药等化学物质混用，以免发生不良反应。
微生物菌肥，富含多糖类、生物碱类、类、腐殖酸类、海藻素等高能量物质以及钾、钙、镁、磷、硫、铁、锌、硼、硒、硅、锰、钼等矿物元素。通过提高作物叶片中叶绿素的含量达到营养复壮、提质增产的效果，通过提高作物体内的酶活性达到、抗逆性的作用；多种有益微生物可有效改良土壤，增加土壤的透气性，提高土壤中有机质的利用率，通过生物菌的固氮、固碳功能为作物补充营养。
生物菌在植物根区迅速增殖，形成优势菌群，占据生态位点，抑制有害菌的侵染，可诱导植物产生过氧化酶、酯氧合酶、β—1.3葡聚糖酸等多种功能物质防御病害。 适用作物：适用于各种作物 用法用量:做底肥使用，将本产品均匀的撒施于土壤表面，然后旋耕于地表下5-10厘米或者锄地进行土壤覆盖；亦可与有机肥、农家肥、化肥混合，进行穴施、沟施、撒施（需深翻） 果树、蔬菜、中药材、茶等经济作物50-100公斤/亩，粮食等普通组作物50公斤/亩 作物生长期，配合冲施2-3次青枯立克和地力旺（液体）效果更佳。
生物菌肥是一种使用微生物菌群作为主要成分的有机肥料。它通过添加益生菌和有益微生物来改善土壤质量和植物生长环境。 生物菌肥中的微生物菌群包括一些对植物生长有促进作用的细菌和真菌，例如固氮菌、磷解菌和有机物分解菌等。这些微生物能够与植物根系共生，提供植物所需的养分，促进植物的生长和发育。
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