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胃中惟一的一种蛋白水解酶。其适pH值为1～2。胃蛋白酶作用的主要部位是芳香族氨基酸或的氨基所组成的肽键。此酶由的主细胞合成，以酶原颗粒形式分泌，经胃液中盐酸激活后，具有消化蛋白质的能力。药用胃蛋白酶，可以从猪胃中提取，用于消化不良。
利用木瓜蛋白酶的酶促反应，可把食品中大分子的蛋白质水解成小分子肽或氨基酸，可制成：肉类嫩化剂，嫩肉粉的生产，啤酒、果汁饮料澄清剂，酒类发酵剂；饼干、面包、面条的减筋生产与加工，饼干松化剂的生产；水解各种动物蛋白质，酱油酿造，酵母抽提物、酵母浸膏生产；在各种动植物食品，蛋白粉，螺旋藻等类生产应用。提高食品的营养价值。
目前中国饲料酶种类有20多种，主要包括：淀粉酶、蛋白酶、木聚糖酶、β－甘露聚糖酶、纤维素酶、β－葡聚糖酶、植酸酶和复合酶等。这些酶制剂可分为两大类：1）以降解多糖和生物大分子物质为主，包括蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶、糖化酶、纤维素酶、木聚糖酶、甘露聚糖酶。主要功能是破坏植物细胞壁，使细胞内容物充分释放出来；2）以降解植酸、β－葡聚糖、果胶等抗营养因子为主，主要包括植酸酶、β－葡聚糖酶和果胶酶，其主要功能是降解细胞壁木聚糖和细胞间质的果胶成分，提高饲料的利用率
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